В соавторстве с коллегами из Израиля, Румынии и Института молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта чл.-корр. РАН А.А. Москалев провел сравнение геномов и транскриптомов долгоживущих и короткоживущих видов млекопитающих. Результаты опубликованы в международном журнале Aging Cell.
Одним из важных вопросов в исследованиях старения является то, как различия в геномике и транскриптомике определяют максимальную продолжительность жизни у разных видов. Несмотря на недавний прогресс, многое еще неясно по этой теме, отчасти из-за отсутствия образцов у немодельных организмов и из-за проблем при прямом сравнении транскриптомов от разных видов. Новый основанный на ранжировании метод, который мы здесь используем, применяется для анализа экспрессии генов у серого кита и сравнения его транскриптома de novo с таковым у других долгоживущих и короткоживущих млекопитающих. Серые киты входят в число 1% самых долгоживущих млекопитающих. Несмотря на экстремальные условия окружающей среды, или, может быть, из-за замечательной адаптации к среде обитания (периодическая гипоксия, арктическая вода и высокое давление), серые киты достигают возраста, по меньшей мере, 77 лет. В этой работе мы показываем, что долгоживущие млекопитающие имеют общие паттерны экспрессии генов между собой, включая высокую экспрессию генов поддержания и восстановления ДНК, убиквитинирование, апоптоз и иммунный ответ. Кроме того, уровень экспрессии у серых китов для ортологов генов, связанных с долголетием или короткой жизнью, обнаруженных в модельных организмах, подтверждает их предполагаемую роль и направление в определении продолжительности жизни. Примечательно, что среди высоко выраженных генов долголетия многие связаны со стрессом, отражая адаптацию к экстремальным условиям окружающей среды. Проведенный анализ транскриптома показывает, что серый кит потенциально обладает высокой устойчивостью к раку и стрессу, по крайней мере, частично объясняя его долголетие. Эта новая сборка транскриптома серого кита также предоставляет важные ресурсы для поддержки усилий по сохранению исчезающей популяции этих китов.
Подробнее: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/acel.13158