Зоологические коллекции ИБ ФИЦ Коми НЦ УрО РАН были основаны в марте 1997 г. в форме «Научного музея Института биологии Коми НЦ УрО РАН», который был официально открыт 29 апреля 1999 года как отдельное подразделение при дирекции Института биологии. С марта 2005 года Научный музей вошел в состав отдела экологии животных. С 2023 года переименован в «Зоологические коллекции ИБ ФИЦ Коми НЦ УрО РАН».
С момента создания в марте 1997 г. научный музей Института биологии последовательно накапливал биологические коллекции. В основе его развития лежит отражение природных ресурсов Республики Коми, информационное обеспечение качественной и количественной оценки биоразнообразия ее природных ресурсов.
Первым заведующим музея была Литвиненко Эмилиана Валентиновна. Она заложила основы музея: обеспечила должное хранение коллекционных материалов, организовала условия для их успешного использования в исследовательской и практической работе сотрудников, создала большую часть существующих демонстративных экспонатов и ландшафтных экспозиций.
Существенным моментом в создании раздела беспозвоночных животных является передача в 1998 г. лабораторией экологии позвоночных животных энтомологической коллекции А.Л. Лобанова (1800 экземпляров 380 видов) и сборов Л.М. Купчиковой и Е.Н. Габовой (более 4000 экз. 898 видов). Коллекция паукообразных содержит значительное число видов – 349 (Е.Н. Мазура). Черви представлены 121 видом нематод (сборы Д.Г. Даниленко). Коллекция паразитофауны включает более 800 экземпляров представителей трематод, дактилогирусов, гиродактилусов, моногеней.
Раздел позвоночных животных в Зоологических коллекциях представлен достаточно хорошо за счет поступлений от научных сотрудников, сборов самого музея, частных лиц. Хранятся представители всех видов рептилий и амфибий, обитающих на территории республики. Широко представлена коллекция различных видов птиц. Среди них – уникальные и редкие экспонаты: беркут, лебедь-кликун, тундровый лебедь, петухоперая самка глухаря, межняк, бородатая неясыть, полярная сова, пискулька, краснозобая гагара. Безусловный интерес вызывает оологическая коллекция (сборы В.П. Галкина, Ю.Н. Минеева, А.А. Естафьева, С.К. Кочанова).
Основой териологической части раздела Зоологических коллекций стала остеологическая коллекция хищных и грызунов, поступившая от Н.М. Полежаева и Г.П. Наумова. Наиболее обширно представлены следующие виды животных: ондатра, белка, заяц-беляк, песец, медведь, волк, куница, горностай. Несомненный интерес вызывает коллекция шкур животных с нетипичным окрасом меха: альбиносы, хромисты, меланисты. Обращают на себя внимание влажные анатомические препараты, изготовленные в 70-80-е гг., демонстрирующие эмбрионы и половые органы лесной куницы, ондатры, зайца-беляка. Коллекция из двадцати чучел знакомит с 13 видами млекопитающих животных.